Arhitektūra sinagogas Bin Эзры ne ar ko neatšķiras no standarta коптских baznīcu. Tas notika tāpēc, ka ēka sākotnēji bija baznīca, bet galu X gs. kalifs Hakim slēgts baznīca. Vēlākos laikos šī ēka atpirka ebreju kopiena, kas tajā laikā sastādīja ievērojamu daļu no ēģiptes sabiedrībā. Sinagoga tika nosaukta par rabīnu Jeruzalemes ben ābrahāma pēcnācējs caur Эзры.

Kļuva slavena sinagoga to, ka XIX gadsimtā, remonta laikā, šeit tika atklāts viens no tūkstošiem dokumentu XI-XII gs.
Nesen sinagogu отреставрировали.