Saskaņā ar tradīciju, nosaukums ir "Мишарина kalns" ir cēlies no kādas дьяка Мунехина Мисюри, kas dzīvoja pirmajā pusē 16 gadsimtā un kas bija pazīstama ar savu labdarības darbību attiecībā uz Dieva draudzēm. Cienījama novadpētnieks Окулич-Казарин N.P. drīzāk visvairāk ticams versiju nosaukuma izcelsme baznīcas mazi purvi, носивших nosaukums мшары, jo tieši šādiem purviem kaut kad senatnē un ir ieskauj kalni.
Torņa mūra baznīcas ir noticis 1547 gadā. Sākotnēji baznīca bija sena klostera. Ierakstos Писцовой grāmatas 1623 gada pieminēts vīriešu Котельниковом klosterī ar Мишариной kalniem. Tieši par to klosterī rakstīts Четьях минеях Krievijas metropolīta Makārija. Ir pieņēmums, ka pārzinis igumens koteļņikova gleznas klostera jau 60-to gadu sākumā 16 gadsimtā bija Vasilijs-Varlaams, kas ir autors житий Aleksandra Ņevska Евфросина Pleskavas.
1808. gadā dievnams bija nojaukšanas kā ļoti vecā, bet tomēr Svētais Sinode nav devis piekrišanu šo notikumu. 1882. gadā tirgonis no Pleskavas Стехновским Pēteris Mihailoviča pie durvīm bija uzstādīta akmens piebūve. Jau 1892-1896 gados tika veikti remonta un restaurācijas darbi uz naudas līdzekļus baznīcas vecākā – Кафельникова Ivans Mihailovičs – goda pilsoņa Pleskavas pilsētas. Baznīcai ir divi troņa, galvenais no kuriem ir troni Evaņģēlists un Apustuļa Jāņa Teologa, bet otrais nosaukts vārdā, Svētā Mocekļa Jāņa Karavīrs. Jau 1786-1808 gadu pie baznīcas ir attiecināms templis Georgija ar Взвоза, bet 1934. gadā piešķīrusi baznīca apustuļiem pielīdzināmo Svēto Cara Konstantīna un viņa mātes Ķēniņienes Helēnas.
Baznīcas tornis tika uzcelts vienlaicīgi ar возведением rīgas Priekšteča Jāņa baznīcas. Uz zvanu tornim karājās seši zvani. Draudzē bija trīs kapelas, выстроенные no koka: Brīnumdara un Svētītāja Nikolaja netālu no ciema Хрястолово, Svētās Mocekles Anastasijas un Преподобной mocekles Anastasijai.
Ja Jāņa Kristītāja baznīcā pastāvēja богадельня, baznīcas приходское aizgādnība, slimnīcas, bet draudzes skolas gan nebija выстроено. Beigās, 19. gadsimta ciematā ar nosaukumu Kazas Krasts tika uzcelta baznīcas draudzes skola, bet drīz 1895 dēļ tuvu citiem pilsētas skolām tā ir slēgta.
Pa perimetru visai baznīcai atrodas kapsēta, kurā apbedīti vēsturnieks un novadpētnieks Цвылев Ar., restaurators Smirnovs V. P., kā arī karavīri, bojā gājušas izpildes laikā sava kara parādu.
Sākot ar 1913. gada, draudzē kalpoja priesteris Колобов Fjodors Vasiļjevičs. 1927. gadā, pēc tam, kad to vairākas reizes арестовывали, Fjodors Vasilyevich сослали uz Ural. Sieva Колобова sekoja viņam, un pēc tam par viņiem nekādu informāciju nav saņēmis. Par-diakons bija Mihails Ļebedevs, bet par viņa turpmākajā dzīvē nekas nav zināms.
23. decembrī 1936. gada tika nolemts slēgt baznīcā, bet saskaņā ar citām ziņām, dievkalpojumi un turpinājās līdz pat Lielais Tēvijas karš. Kara laikā dievnams ieguvis kādu traumu sienām, jumtiem, iekšējās un ārējās apdares. Jau 1970-1989 gadu arhitekta vadībā Ļebedeva V. A. bija veikt pilnīga restaurācija baznīcas. 3. martā 1965. gada baznīcas kapos ir slēgta apbedījumiem.
Pirmie dienests sāka veikta 1992. gadā, kad faktiski ieejas dievnamā. Baznīcas atdzimšana Svētā Jāņa Kristītāja cieši savijas ar nosaukumu slavenā igumena Joni. Palīdzēja atjaunot baznīcas un direktors kabeļu pleskavas rūpnīcas maz uzvarai Viktors Petrovičs.
2001. gadā Pleskavas arhibīskaps Eusebius kalpoja rituālu iesvētīšanas astoņi zvani, kas tika lieti pilsētā Воронеже pēc senās metodes. Šodien baznīcā darbojas svētdienas skola un notiek svētceļojuma dienests, kas ir saņēmis statusu diecēzes.