Zooloģiskais dārzs un dabas muzejs Split parādījās pateicoties ko pilsētai XX gadsimta sākumā vairākus vērtīgus dabas kolekcijas. Profesors Humberto Джирометта 1923. gadā aktualizēja jautājumu par Muzeja izveidi, dabas vēstures. Pašvaldības padome Splitas ir pieņēmusi šo jautājumu izskatīšanai un 1924. gadā tika dibināta pirmā muzejs, kā Джирометта kļuva par tās vadītāju līdz pat savai nāvei 1939. gadā.

Pirmajos pastāvēšanas gados muzejs atradās vienā no pašvaldības ēku pašā pilsētas centrā. Drīz telpās bija garām, un muzejs pārcēlās uz vienu no parka ēkas Marians. Kopā ar muzeja tika atklāts arī mazs zoo, представлявший dažas sugas vietējo un eksotisko dzīvnieku. Pirmā bijušās Dienvidslāvijas teritorijā Okeanārija pie ēkas muzeja bija выстроено papildu telpas. Dažus gadus vēlāk Akvārijs bija slēgts, un pārvērst nelielu terāriju. Šodien zoo Splitā ir vairāk nekā 300 dažādu sugu dzīvnieki.

Ēka parkā Marians laikā karadarbības 1991. gadam bija slēgta drošības nolūkos. Pēc tam muzejs pārcēlās uz cietoksnis Грипе, bet pēc 1997. gada atkal atgriezies Marians. Pēc 2000 gada, pēc pieprasījuma darbinieku, zem Muzeja vajadzībām bija atvēlēts jaunu telpu, ar kopējo platību aptuveni 1156 kv. m, kurā Muzejs uzsāka darbu 2002. gada janvārī.

Pirms atvēršanas jauno muzeja direktors tika veikta reorganizācija muzeja, переучтены kolekcijas un pievieno dažas jaunas ekspozīcijas (piem., kolekcija scarecrows dzīvnieku un putnu, nodaļa ģeoloģijas un paleontoloģijas, энтомологии, nodaļa mugurkaulnieku un bezmugurkaulnieku un tā tālāk). Tika veiktas arī apstrādes darbus un organizēt izstādes, lauka pētījumi centrālajā daļā Dalmācijā, un vairākas tematiskās izstādes muzejā un ārpus tā. Bez tam, Muzeja darbinieki ir iesaistīti daudzās zinātniskās konferencēs.

Muzeja pirmajā stāvā tiek rīkotas dažādas tematiskās izstādes, bet pārējos divos stāvos izvietotas pastāvīgas ekspozīcijas. Ikviens var iegādāties muzejā papildu materiāli vēstures muzeja un vietējo dabas vēstures.