Rīgas vēstures un kuģniecības muzejs atrodas vecrīgā перестроенном ēkā bijušā Doma katedrāles. Tas ir ne tikai vecākais muzejs Latvijā, bet arī Eiropā.

Pirmsākumi izveidotu muzeja datējami ar 18 gadsimtā. Pamatā bagāts fondu atrodas eksponātu kolekcija, Rīgas ārsta Nikolausa fon Himzela (1729-1764). Pēc nāves Nikolausa, viņa māte, saskaņā ar dēlu, uzdāvināja eksponāti, kuru vidū bija естественнонаучные, mākslas, kā arī vēstures priekšmeti, dāvanu Rīgā. Rīgas valdnieki februārī 1773 gada ir dota norāde dibināt muzejs, nosaucot savu vārdu Himzela. Tad muzejs atradās Anatomijas teātra telpās, atradās uz Kalēju ielu 34/36. Līdz mūsu dienām šī ēka, diemžēl, nav saglabājusies.

1791 muzejs pārcēlās uz austrumu spārns Doma, speciāli iekārtota muzeja vajadzībām un pilsētas bibliotēkas. 1816. gadā muzejā atklāja mākslas kabinetu, bet 19. gs. beigās – pilsētas monētu kabinets. Attīstības muzeja saistīta ar darbībām, dažādu biedrību, kolekcijas, kurā apskatāmi muzejā 1858. gadā. 1890. gadā biedrības, kas piedalījās muzeja dzīves, (biedrība,, pētot vēstures un senatnes Baltijas provincēs Krievijā, Literāri praktiskās savienības pilsoņu un citas) ir ieradušies, kopā ar kolekcijām, Doma ansamblis, kurā vajadzībām muzejā uzcelti ēka str. Palasta 4.

1932. gadā Doma muzejs, ieskaitot esošās kolekcijas, pievienojusies sarakstam Vadības objekti pieminekļi Latvijas Republikā, bet pēc četriem gadiem tika slēgta. Vienlaikus pilsētas pārvalde pilsētas ir radījis Rīgas pilsētas vēstures muzejs. Attīstību, jaunizveidotā muzeja tika apturēta sakarā ar to, kas sākās Otrais Pasaules karš, bet vēlāk viņam traucēja padomju okupācija. Par visu šo sarežģīto periodu ne vienu reizi vien mainīja savu nosaukumu, sākot ar 1964.gada, un līdz pat šai dienai sauc par muzeju un Rīgas vēstures un kuģniecības muzejs.

2005. gadā Rīgas vēstures un kuģniecības Muzejs tika pārveidots par Valsts aģentūru. Šobrīd muzejā glabājas vairāk nekā pusmiljons priekšmetu, sadalīts 80 kolekcijas. Būtiskākie kolekcijām ir arheoloģiskā un нумизматическая. Sastāvā muzeja 3 filiāle – Mencendorfa Nams Rīgā, Latvijas Fotogrāfijas Muzejs un Muzejs Айнажского мореходного skolas.