Pirmā universitāte pēča parādījās 1367 gadā kā viens no vecākajiem Centrālajā Eiropā karaļa Ludviķa Lielā, viņa gāja zem laikā turcijas okupācijas. 1921. gadā bijušā Ungārijas universitāte Bratislavā (to. Bratislavu, ungāru : Пожонь ) pārcēlās uz Pēča, tas результатом1982 Janus Паннониус universitātes ( Janus Паннониус Tudományegyetem, JPTE ).

Pirmā universitāte pēča tika izveidota Людовиком I Ungārijā 1367. Просуществовав kā vienotu izglītības centrs, vairākas desmitgades vidū 15 gadsimtā tā sadalījās divās skolās - jurisprudences un teoloģijas. Gadā turcijas okupācijas universitātē tika slēgts, un atvēra savas durvis tikai 1785. gadā, kad Jāzeps II ir pārcēlušies Karalisko Akadēmiju no Дьера, Pec. 1802 Karaliskā Akadēmija atgriezās Дьер rīkojumu Franciska I, un iestādes augstākās izglītības pēča nebija, līdz 1833 gada, kad bīskaps pilsētas Pec izvietots pilsētas senāta nodibināja pēča Akadēmiju ar fakultātēm tiesību un filozofijas.

Moderna universitāte pilsētas Pec dibināts 1912. gadā un sākotnēji atradās Пожонь (pašreizējā Bratislava). Pēc Pirmā pasaules kara Пожонь bija анексирован no Ungārijas, un 1921. gadā universitāte pārcēlās uz Pēča, kur tā paliek līdz pat šai dienai. 1951. gadā universitātes medicīnas fakultāti bija atdalīta, un līdz 2000. gadam bija atsevišķu iestādi. 1982. gadā universitāte ieguva nosaukumu Януса Паннониуса. Īsts universitātē pilsētas Pec tika izveidots 2000. gada 1. janvāra, apvienojoties universitātes Януса Паннониуса, Medicīnas universitātes pilsēta, un pedagoģiskās koledžas.