Botāniskais dārzs tika ielikts 1772-1774 gados. Gandrīz uzreiz pēc dibināšanas to apvienoja ar Valsts vēstures muzeju, kura radītājs bija marķīzs Помбал. Vietu dārza izvēlējās vice-kanclers Universitātes Коимбры Francisco de Лемос. Dārzs atrodas uz zemes, kas agrāk piederēja Skolā Svētā Бенто, atrašanās vietu kurā bija ieleja Урсулинок. Pirmais kurators dārzā tika Домингос Ванделли, bet 1791 to nomainīja Фелик Алевар Бротеро, profesors, botānikas un lauksaimniecība. Dārzu paplašināja pastāvīgi, parādījās jauni augu eksemplāri, un uz doto brīdi dārza platība ir 13 hektāri.

Universitātes botāniskais dārzs Коимбры uzskatīts par vienu no skaistākajiem dārziem Eiropā un sastāv no divām daļām. Viena tā daļa atrodas uz augstienes, un tā ir sadalīta uz terases. Apakšējā terase dots nosaukums Квадрадо Central un ir senākā daļa no dārza. Terasi rotā strūklaka 40-tajiem gadiem, var redzēt koki stādīti laikos курирования dārza Fēliksu Бротеро. Dekora elementi terases ir daudz kopīga ar dekoru eiropas dārzu XVIII gadsimtā. Uz citu terasēm var redzēt siltumnīcas tropu un субтропическими kokiem un puķu dobes veselu kolekcijas augiem. Uz šiem puķu dobes augi ir sadalīti pa grupām таксономически un audzē izmantošanai studentiem-ботаниками, kā arī, lai apmainītos ar citiem līdzīgiem institūtiem visā pasaulē, kuriem ir botāniskie dārzi.

Otrajā daļa no dārza upes ieleja, caur kuru plūst neliels strauts, un kur atrodas dendrārijs. Tur aug daudz bambusa koku un citu eksotisko augu. Arī otrā daļa no dārza ir slavena ar lielisko kolekciju, eikalipta (51 skats). Dārzā mīt putni. Ģimenes brūnu olbaltumvielas ir daļa no ekosistēmas, kas veiksmīgi tika ieviesta 1994. gada jūnijā. Olbaltumvielas ir pirmie dzīvnieki, kas labi jāpielāgo vides un sāka vairoties.